MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halobacillus halophilus DSM 2266

Total Repeats: 17197

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017668	T	7	7	1	7	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017668	AAAAT	2	10	21	30	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017668	TG	3	6	54	59	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017668	T	7	7	64	70	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017668	TGT	2	6	138	143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017668	TAT	2	6	207	212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017668	TTA	2	6	286	291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017668	ACA	2	6	426	431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017668	T	7	7	475	481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017668	CATC	2	8	1894	1901	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017668	AAC	2	6	1902	1907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017668	GTTT	2	8	1931	1938	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017668	TACTAT	2	12	1974	1985	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017668	TAA	2	6	1996	2001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017668	A	6	6	2000	2005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017668	AT	3	6	2009	2014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017668	AGG	2	6	2029	2034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017668	A	6	6	3189	3194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017668	GTCA	2	8	3215	3222	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017668	TAAAA	2	10	3343	3352	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017668	TGAA	2	8	3377	3384	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017668	ATGG	2	8	7065	7072	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017668	TTA	2	6	7108	7113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017668	GCC	2	6	9689	9694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_017668	GGC	2	6	9712	9717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017668	AG	3	6	9764	9769	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017668	TCA	2	6	11633	11638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017668	GCAA	2	8	11656	11663	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017668	T	7	7	11738	11744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017668	ACA	2	6	11756	11761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017668	TTA	2	6	11814	11819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017668	GA	3	6	11852	11857	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017668	ATTT	2	8	14788	14795	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017668	T	6	6	14811	14816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017668	CAT	2	6	14851	14856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017668	TGAT	2	8	14862	14869	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017668	GGA	2	6	14888	14893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017668	GATT	2	8	15831	15838	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017668	TTA	2	6	16494	16499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017668	TAA	2	6	16511	16516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017668	GAT	2	6	16524	16529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017668	TAG	2	6	16536	16541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017668	CAT	2	6	16542	16547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017668	AG	3	6	16560	16565	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017668	TGA	2	6	16584	16589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017668	TG	3	6	16596	16601	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017668	ATCC	2	8	16603	16610	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017668	GGT	2	6	16698	16703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017668	ATTA	2	8	16763	16770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017668	GAG	2	6	16779	16784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017668	A	6	6	18086	18091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017668	T	6	6	18121	18126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017668	GTTT	2	8	18148	18155	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017668	TTA	2	6	18167	18172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017668	TGG	2	6	18245	18250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017668	CTCG	2	8	18290	18297	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017668	CCA	2	6	18357	18362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_017668	GAA	2	6	18379	18384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017668	TA	3	6	18437	18442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017668	GTA	2	6	18490	18495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017668	GAT	2	6	18560	18565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017668	GAG	2	6	18618	18623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017668	ATC	2	6	18651	18656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017668	CT	3	6	18822	18827	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017668	A	6	6	18842	18847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017668	AT	4	8	18855	18862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017668	ATATT	2	10	18884	18893	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017668	GGA	2	6	18909	18914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017668	CTC	3	9	18988	18996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_017668	TAT	2	6	19005	19010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017668	CAA	2	6	19011	19016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017668	ATA	2	6	19023	19028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017668	AGC	2	6	19049	19054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017668	GCT	2	6	19065	19070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017668	T	6	6	19070	19075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017668	GAACA	2	10	19138	19147	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017668	GCAG	2	8	19164	19171	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017668	GAAT	2	8	19224	19231	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017668	CTTT	2	8	19256	19263	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017668	AT	3	6	19280	19285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017668	TACT	2	8	19286	19293	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017668	A	7	7	19314	19320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017668	TCT	2	6	20677	20682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017668	CCT	2	6	20683	20688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_017668	GCAC	2	8	20708	20715	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017668	CAGA	2	8	20793	20800	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017668	AGGA	3	12	20839	20850	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017668	GAA	2	6	20857	20862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017668	TTCA	2	8	20870	20877	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017668	ATT	2	6	20987	20992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017668	A	8	8	21048	21055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017668	TGG	2	6	21077	21082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017668	TTA	3	9	21105	21113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017668	GA	4	8	21199	21206	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017668	AAG	2	6	21232	21237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017668	ATT	2	6	21266	21271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017668	ATA	2	6	21277	21282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017668	A	6	6	21282	21287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017668	CCT	2	6	21933	21938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_017668	CCT	2	6	23414	23419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_017668	AAAGA	2	10	23471	23480	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017668	AAGAA	2	10	23485	23494	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017668	ATTT	2	8	24192	24199	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017668	A	6	6	24262	24267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017668	GTA	2	6	24308	24313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017668	AG	3	6	24323	24328	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017668	AATGA	2	10	24334	24343	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017668	GGA	2	6	24346	24351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017668	CTA	2	6	24370	24375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017668	GTA	2	6	24376	24381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017668	AAT	2	6	24445	24450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017668	GGA	2	6	24536	24541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017668	T	7	7	24823	24829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017668	TCCT	2	8	25044	25051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017668	AGG	2	6	25159	25164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017668	TTC	2	6	28098	28103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017668	T	6	6	28115	28120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017668	TAT	2	6	28173	28178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017668	T	6	6	28222	28227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017668	TAAA	2	8	28282	28289	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017668	A	6	6	28372	28377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017668	TGA	2	6	30119	30124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017668	T	7	7	30154	30160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017668	ATA	2	6	30237	30242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017668	GAA	2	6	30243	30248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017668	T	7	7	32957	32963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017668	GAT	2	6	33040	33045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017668	AACA	2	8	34069	34076	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017668	GA	3	6	34090	34095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017668	AGG	2	6	34099	34104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017668	T	6	6	36798	36803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017668	A	6	6	36804	36809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017668	ATT	2	6	36818	36823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017668	ATA	2	6	36838	36843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017668	GCCT	2	8	36938	36945	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017668	GTG	2	6	36953	36958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017668	GGAA	2	8	37008	37015	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017668	GCA	2	6	37016	37021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017668	ATC	2	6	37030	37035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017668	GGTG	2	8	37103	37110	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017668	T	7	7	37168	37174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017668	GTTAT	2	10	37194	37203	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017668	TTA	2	6	37216	37221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017668	AG	3	6	37283	37288	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017668	AG	3	6	37337	37342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017668	TCC	2	6	37350	37355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_017668	CAT	2	6	37395	37400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_017668	TCA	2	6	37419	37424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_017668	TCA	2	6	37439	37444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_017668	GGT	2	6	37461	37466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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